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IMAGERIE CELLULAIRE

Présentation

PRÉSENTATION

La microscopie à fluorescence joue un rôle indispensable dans la recherche biomédicale, offrant des perspectives pour l'exploration des mécanismes cellulaires et tissulaires. Au sein de la SFR Necker, notre plateforme d'imagerie cellulaire se distingue par son expertise pointue dans la visualisation et l'analyse de structures complexes ainsi que des processus dynamiques. Notre champ d'investigation s'étend de l'échelle microscopique, au niveau cellulaire, jusqu'à celle de l'organisme entier, permettant une compréhension approfondie des phénomènes biologiques.

 

Notre objectif premier est de fournir aux chercheurs un accès privilégié à des équipements optiques de pointe, leur permettant de relever avec succès les défis scientifiques les plus complexes. En parallèle, notre équipe s'engage activement dans le développement et la mise en œuvre de méthodes d'imagerie innovantes, afin de répondre aux besoins évolutifs de la communauté scientifique.

 

Ouverte à tous les instituts de recherche ainsi qu'aux acteurs de l’industrie privée, notre plateforme constitue un lieu d'échange et de collaboration privilégié propice à l'émergence de nouvelles idées et à la réalisation de projets ambitieux dans les domaines de la biologie et de la médecine.

LOCALISATION

Plateforme d'imagerie cellulaire

Institut Imagine, 24 bd du Montparnasse, 75015 Paris

La plateforme est située à l'Institut Imagine et dispose d'une antenne
à la Faculté de Médecine Necker.

Tel: 01 42 75 43 91

Mail: imagerie.sfr.necker@inserm.fr

PERSONNEL

Meriem GARFA-TRAORÉ

 Responsable - IR INSERM

Béatrice DUREL

IR Inserm

Marine PANZA

IECN Unipersité Paris Cité

Gaël MENASCHÉ, PhD

Référente scientifique, DR2 Inserm

Elisa HERPIN

IECN Unipersité Paris Cité

Équipement

ÉQUIPEMENT

MISSION

Les missions principales de la plateforme sont de :

  • conseiller les utilisateurs dans la conception et la mise en œuvre de leurs expériences,

  • accompagner les utilisateurs dans la préparation de leurs échantillons pour la microscopie de super-résolution, la microscopie d’expansion, ou la transparisation,

  • mettre à disposition des utilisateurs les systèmes d'imagerie les plus adaptés
    à leurs problématiques scientifiques,

  • aider et former les utilisateurs sur tous les systèmes d'acquisition,

  • collaborer avec les chercheurs sur l'utilisation de techniques avancées,

  • aider les utilisateurs dans l'interprétation et la mise en forme de leurs résultats.

Missions

La plateforme dispose d'une gamme variée de microscopes qui permettent de couvrir
un large éventail de techniques et de réaliser des observations à différentes échelles.

IMAGERIE STRUCTURELLE ET VIVANTE

  • 4 microscopes confocaux à balayage laser : 1 Nikon AX, 2 Leica SP8, 1 Leica SP5

  • 2 microscopes confocaux à disque rotatif spinning disk : Yokogawa CSU-X1
    sur Zeiss Axio-observer Z1

  • 4 microscopes à champ large : deux microscopes à illumination structurée Zeiss ApoTome, un microscope à fluorescence TIRF Nikon, un microscope inversé Zeiss Axiovert A1

​​

  • 1 microscope confocal haut débit: Opera Phenix (HCS)

  • 1 système d’imagerie entièrement automatisé : Thermo Fisher EVOS M7000

 

ANALYSE D'ULTRASTRUCTURE

  • 1 microscope super-résolution STED : Leica SP8-gSTED

  • 1 microscope super résolution STORM :« home made » sur Nikon Eclipse Ti

​​

IMAGERIE TRIDIMENSIONNELLE

  • 1 microscope à feuille de lumière : Zeiss Lightsheet Z1

  • 1 micro-tomodensitomètre (microCT) : Bruker Skyscan 1272

 

AUTRES ÉQUIPEMENTS

La plateforme dispose de deux scanner de lames de capacité de 210 lames.

 

  • 1 stéréomicroscope à fluorescence : Leica M205 FCA

  • 1 loupe : Zeiss Stemi 305

  • 1 réfractomètre Mettler Toledo

  • 1 Ibidi Pump System

Publications

FRAIS

Sur demande à meriem.garfa@inserm.fr

PUBLICATIONS

2023

The AMPK-Sirtuin 1-YAP axis is regulated by fluid flow intensity and controls
autophagy flux in kidney epithelial cells.

A.Claude-Taupin, P.Isnard, A.Bagattin, N.Kuperwasser, F.Roccio, B.Ruscica, N.Goudin, M.Garfa-Traoré, ..., F.Terzi, P.Codogno & N. Dupont
Nature Communications, 2023 December

 

Fluid shear stress triggers cholesterol biosynthesis and uptake in inner medullary collecting duct cells, independently of nephrocystin-1 and nephrocystin-4.

M.Garfa Traoré, F.Roccio, C.Miceli, G.Ferri, M.Parisot, N.Cagnard, M.Lhomme, N.Dupont, A.Benmerah, S.Saunier, M.Delous
Frontiers in Molecular Biosciences, 2023 October

 

DOCK11 deficiency in patients with X-linked actinopathy and autoimmunity.

Boussard C, Delage L, Gajardo T, Kauskot A, Batignes M, Goudin N, Stolzenberg MC,
Brunaud C, Panikulam P, Riller Q, Moya-Nilges M, Solarz J, Repérant C, Durel B, ...
Ménager M, Sepulveda FE, Adam F, Rieux-Laucat F.

Blood, 2023 June

 

Bi-allelic variations in CRB2, encoding the crumbs cell polarity complex component 2,
lead to non-communicating hydrocephalus due to atresia of the aqueduct of sylvius
and central canal of the medulla.

A.Tessier, N.Roux, L.Boutaud, E.Lunel, L.Hakkakian, M.Parisot, M.Garfa‐Traoré, ...,
T.Attié‐Bitach and S.Thomas
Acta Neuropathologica Communications, 2023 February

 

Evaluation of Slowfade Diamond as a buffer for STORM microscopy.

Boukhatem H, Durel B, Raimbault M, Laurent A, Olivier N.
Biomed Opt Express, 2023 January.

 

2022

UNC45A deficiency causes microvillus inclusion disease-like phenotype
by impairing myosin VB-dependent apical trafficking.

R.Duclaux-Loras, C.Lebreton, J.Berthelet, F.Charbit-Henrion, O.Nicolle, C.Revenu des Courtils, S.Waich, T.Valovka, A.Khiat, M.Rabant, C.Racine, IC.Guerrera, J.Baptista, M.M Mahe, M.W Hess, B.Durel.... N.Cerf-Bensussan, M.Parlato.

JCI, 2022 May.

 

Agonists of prostaglandin E2 receptors as potential first in class treatment
for nephronophthisis and related ciliopathies.

H.Garcia, A.Serafin, F.Silbermann, E.Porée, A.Viau, C.Mahaut, K.Billot, E.Birgy, M.Garfa-Traore, .... M.Delous, L.Briseño-Roa, S.Saunier.
PNAS, 2022 May

 

2021

Quantitative dSTORM super-resolution microscopy localizes Aurora kinase A/AURKA
in the mitochondrial matrix.

B.Durel, C.Kervrann, G.Bertolin.
Biol Cell, 2021 November

 

ATG9A protects the plasma membrane from programmed
and incidental permeabilization.

Claude-Taupin A, Jia J, Bhujabal Z, Garfa-Traoré M, ..., Reggiori F, Deretic V.
Nat.Cell Biol, 2021 August.

 

Three-dimensional architecture of nephrons in the normal and cystic kidney.

Blanc T, Goudin N, Zaidan M, Traore MG, Bienaime F, Turinsky L, Garbay S, Nguyen C, Burtin M, Friedlander G, Terzi F, Pontoglio M.
Kidney Int., 2021 March

 

Mobilized Multipotent Hematopoietic Progenitors Promote Expansion and Survival
of Allogeneic Tregs and Protect Against Graft Versus Host Disease.

D'Aveni M, Notarantonio AB, Agbogan VA, Bertrand A, Fouquet G, Gastineau P, Garfa-Traoré M, De Carvalho M, Hermine O, Rubio MT, Zavala F.
Front Immunol, 2021 February.

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