Imagerie cellulaire
Présentation
La microscopie à fluorescence est un outil essentiel dans la recherche biomédicale.
La plateforme d'imagerie cellulaire SFR Necker est spécialisée dans la visualisation et l'analyse de la structure et des processus dynamiques, au niveau cellulaire et tissulaire jusqu'au niveau de l'organisme entier.
Sa mission est de fournir aux chercheurs des instruments optiques et des outils d'analyse avancés, leur permettant de répondre à leurs problématiques scientifiques.
Le personnel de la plateforme développe également des méthodes d'imagerie nouvelles et toujours plus innovantes.
La plateforme est ouverte à tous les instituts de recherche et aux industries privées.
Localisation
La plateforme est située à l'Institut Imagine et dispose d'une antenne à la Faculté de Médecine de l'Université de Paris.
Plateforme d'Imagerie Cellulaire de la SFR Necker (UMS 24)
Institut Imagine, 24 bd du Montparnasse, 75015 Paris
Tél : 01 42 75 43 91
Personnel
Béatrice Durel
IE Inserm
Huyen AUGIS-CHU, PhD
IE - Université de Paris
Équipement
La plateforme est équipée de plusieurs systèmes pour couvrir un large éventail de techniques :
• Pour l'imagerie structurelle et vivante :
6 microscopes confocaux dont deux disques rotatifs (Yokogawa CSU-X1)
3 microscopes à grand champ : deux microscopes illuminés structurés (Zeiss ApoTome) et un microscope à fluorescence à réflexion interne totale (Nikon)
• Pour la microscopie fonctionnelle :
1 microscope pour les analyses de durée de vie en fluorescence et spectroscopie de corrélation de fluorescence (Leica SP8-SMD)
• Pour l'analyse d'ultrastructure :
1 microscope super-résolution STED (Leica SP8-STED)
1 microscope super résolution STORM (fait maison)
• Pour l'imagerie en profondeur :
1 microscope lightsheet (Zeiss Lightsheet Z1)
Larve de drosophile observée au microscope optique après éclaircissement.
• Autres petits équipements :
1 loupe
1 stéréomicroscope à fluorescence
2 microscopes à épifluorescence : 1 inversé pour culture cellulaire / 1 droit pour lames
Frais
Les missions de la plateforme sont :
• conseiller les utilisateurs dans la conception et la mise en œuvre de leur expérience (préparation des échantillons, choix des fluorochromes, etc.)
• mettre à disposition des utilisateurs les systèmes d'imagerie les plus adaptés à leurs problématiques scientifiques
• aider et former les utilisateurs sur tous les systèmes d'acquisition
• collaborer avec les chercheurs sur l'utilisation de techniques avancées, pour leur permettre d'aller plus loin dans la compréhension des modèles biologiques
• assister les utilisateurs dans l'interprétation et la mise en forme des résultats
Publications
1. Quantitative dSTORM super-resolution microscopy localizes Aurora kinase A/AURKA in the mitochondrial matrix. Durel B, Kervrann C, Bertolin G. Biol Cell. 2021 Aug 31. doi: 10.1111/boc.202100021.
2. ATG9A protects plasma membrane from programmed and incidental 1 permeabilization.
Aurore Claude-Taupin, Jingyue Jia, Zambarlal Bhujabal, Meriem Garfa- Traoré, Suresh Kumar, Gustavo Peixoto Duarte da Silva, Ruheena Javed, Yuexi Gu, Lee Allers, Ryan Peters, Fulong Wang, Luciana Jesus da Costa, Sandeep Pallikkuth, Keith A. Lidke, Mario Mauthe, Pauline Verlhac, Yasuo Uchiyama, Michelle Salemi, Brett Phinney, Sharon A. Tooze, Muriel C. Mari, Terje Johansen, Fulvio Reggiori, and Vojo Deretic. Nature Cell Biology, April 2021
3. Three-dimensional architecture of nephrons in the normal and cystic kidney.
Thomas Blanc, Nicolas Goudin, Mohamad Zaidan, Meriem Garfa–Traore, Frank Bienaime, Lisa Turinsky, Serge Garbay, Clément Nguyen, Martine Burtin, Gérard Friedlander, Fabiola Terzi, Marco Pontoglio. Kidney International, March 2021
4. Mobilized Multipotent Hematopoietic Progenitors Promote Expansion and Survival of Allogeneic Tregs and Protect Against Graft Versus Host Disease -.
Maud D'Aveni, Anne-Béatrice Notarantonio, Viviane A Agbogan, Allan Bertrand, Guillemette Fouquet, Pauline Gastineau, Meriem Garfa-Traoré, Marcelo De Carvalho, Olivier Hermine, Marie-Thérèse Rubio, Flora Zavala. Front Immunol, Feb 2021
5. Comparison of different clearing and acquisition methods for 3D imaging of murine intestinal organoids.
Louison Lallemant, Corinne Lebreton, Meriem Garfa–Traoré. Journal of Biological Methods, 2020.
6. Light sheet fluorescence microscopy versus confocal microscopy: in quest of a suitable tool to assess drug and nanomedicine penetration into multicellular tumor spheroids.
Lazzari G, Vinciguerra D, Balasso A, Nicolas V, Goudin N, Garfa–Traore M, Fehér A, Dinnyés A, Nicolas J, Couvreur P, Mura S. Eur J Pharm Biopharm. Sept 2019
7. Human IFT52 mutations uncover a novel role for the protein in microtubule dynamics and centrosome cohesion.
Dupont MA, Humbert C, Huber C, Siour Q, Guerrera IC, Jung V, Christensen A, Pouliet A, Garfa–Traoré M, Nitschké P, Injeyan M, Millar K, Chitayat D, Shannon P, Girisha KM, Shukla A, Mechler C, Lorentzen E, Benmerah A, Cormier–Daire V, Jeanpierre C, Saunier S, Delous M. Hum Mol Genet. Aug 2019
8. Targeting Type IV pili as an antivirulence strategy against invasive meningococcal disease.
Denis, K., Bris, M. L., Guennec, L. L., Barnier, J.–P., Faure, C., Gouge, A., Bouzinba–Ségard, H., Jamet, A., Euphrasie, D., Durel, B., Barois, N., Pelissier, P., Morand, P. C., Coureuil, M., Lafont, F., Join–Lambert, O., Nassif, X. & Bourdoulous, S. Nature Microbiology, Jun 2019
9. Ependymal cilia beating induces an actin network to protect centrioles against shear stress.
Mahuzier A, Shihavuddin A, Fournier C, Lansade P, Faucourt M, Menezes N, Meunier A, Garfa–Traoré M, Carlier MF, Voituriez R, Genovesio A, Spassky N, Delgehyr N. Nat Commun. Jun 2018
10. Impaired Transferrin Receptor Palmitoylation and Recycling in Neurodegeneration with Brain Iron Accumulation.
Drecourt A, Babdor J, Dussiot M, Petit F, Goudin N, Garfa–Traoré M, Habarou F, Bole–Feysot C, Nitschké P, Ottolenghi C, Metodiev MD, Serre V, Desguerre I, Boddaert N, Hermine O, Munnich A, Rötig A. Am J Hum Genet. Feb 2018
11. Strength of Neisseria meningitidis binding to endothelial cells requires highly-ordered CD147/β 2-adrenoceptor clusters assembled by alpha-actinin-4.
Nawal Maïssa, Valentina Covarelli, Sébastien Janel, Béatrice Durel, Nandi Simpson, Sandra C. Bernard, Liliana Pardo–Lopez, Haniaa Bouzinba–Ségard, Camille Faure, Mark G. H. Scott, Mathieu Coureuil, Philippe C. Morand, Frank Lafont, Xavier Nassif, Stefano Marullo & Sandrine Bourdoulous. Nature Communications Jun 2017