ACTU
2026
OCTOBRE
Journée scientifique du campus Necker
Le 8 octobre 2026, la SFR Necker a réuni la communauté scientifique du campus Necker à l’occasion de la Journée scientifique annuelle, mettant à l’honneur des projets de recherche s’appuyant notamment sur ses plateformes technologiques.
Cette journée a été l’occasion de découvrir la diversité des projets scientifiques menés au sein du campus et de mettre en lumière les apports des plateformes technologiques à travers plusieurs sessions thématiques :
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Plasticité cellulaire
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Biologie des systèmes
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Nouveautés technologiques des plateformes de la SFR Necker et de BIGR
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Homéostasie de la peau
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Vers une thérapie ciblée
La SFR Necker remercie chaleureusement la Dr. Alessandra Pierani pour sa "Keynote lecture" consacrée aux liens entre développement cortical et perspectives thérapeutiques.
Nous avons également eu le plaisir d'accueillir la Pr. Sabine Sarnacki, Doyenne de l'UFR de médecine de l'Université Paris Cité, ainsi que Maxime Rolland avec laquelle nous avons pu échanger sur la Science ouverte.
Cette journée illustre l’importance des échanges interdisciplinaires et des collaborations entre équipes de recherche et plateformes technologiques, au service de l’innovation scientifique et de l’avancée des connaissances.
Cette journée illustre l’importance des échanges interdisciplinaires et des collaborations entre équipes de recherche et plateformes technologiques, au service de l’innovation scientifique et de l’avancée des connaissances.
AOÛT
Évolution technologique de la plateforme protéomique : acquisition du cellenONE X1 NEO, du timsTOF Ultra AIP
et de l'Evosep Eno
a plateforme protéomique enrichit son parc technologique avec l'acquisition de nouveaux équipements de pointe : le système de tri et de manipulation de microvolumes cellenONE X1 NEO en 2025, ainsi que le spectromètre de masse timsTOF Ultra AIP et le système de chromatographie Evosep Eno en 2026.
Le cellenONE permet un isolement automatisé et précis des cellules uniques, optimisant la préparation des échantillons en amont. Associé au timsTOF Ultra AIP et à la vitesse de séparation de l'Evosep Eno, cet ensemble offre une sensibilité, une résolution et un débit d'analyse accrus, permettant d'étudier des quantités d'échantillons extrêmement faibles tout en traitant des séries d'analyses plus importantes.
Ces investissements renforcent l'offre de service de la plateforme, notamment pour les analyses de protéomique à l'échelle de la cellule unique (single-cell proteomics).
2024
NOVEMBRE
Nouveau Spectromètre de Masse Thermo Orbitrap Exploris 240 sur la plateforme d'analyses métaboliques
Une plateforme d'analyse métabolique a amélioré ses capacités grâce à un nouveau système LC-MS à la pointe de la technologie. L'ajout du spectromètre de masse Orbitrap Exploris 240 améliorera considérablement les analyses métabolomiques non ciblées de la plateforme. Son flux de travail d'acquisition de données AcquireX™ est essentiel pour ce type d'études, permettant la collecte de données plus riches et plus informatives.
SEPTEMBRE
Nouveau scanner de lame haute vitesse VS200sur la plateforme d’histologie
La plateforme d’histologie s’est récemment dotée d’un scanner de lame haute vitesse VS200 (Olympus, Evident), acquis fin 2024. Cet investissement stratégique a été rendu possible grâce au financement conjoint de l’AAP Gros Équipements de l’Université Paris Cité, des instituts Imagine, INEM, ainsi que de la plateforme d’histologie.
Le VS200 offre une capacité de numérisation de 210 lames réparties sur 35 plateaux de 6 lames, permettant un traitement efficace des projets à haut débit. Il propose plusieurs modalités d’imagerie : fond clair, fluorescence (DAPI, FITC, Cy3, Cy5, Cy7) et lumière polarisée, notamment pour l’analyse du collagène en coloration Picro‑sirius.
L’équipement est doté d’objectifs 2x, 4x NA 0.13, APO20x NA 0.8 et APO40x NA 0.95, ainsi que de deux systèmes de détection complémentaires : une caméra couleur CMOS pour le fond clair et une caméra monochrome ORCA‑Fusion, particulièrement sensible, dédiée à la fluorescence.
Ce nouvel instrument renforce les capacités d’imagerie de la plateforme et soutient l’ensemble des équipes du campus dans leurs projets de recherche.
2023
SEPTEMBRE
Necker Proteomics has introduced a new technology dedicated to plasma biomarker research:
Proteograph from Seer.
The Proteograph Assay is based on the formation of a protein corona on functionalized nanoparticles, which dramatically increases the number of plasma proteins quantified by mass spectrometry (from 800 to over 4000).
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MARS
La Plateforme Protéomique de Necker (PPN) a obtenu en mars 2023 deux certifications importantes : ISO 9001 et NF X50-900 pour les "Services et activités de recherche et développement en protéomique clinique et translationnelle".
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ISO 9001 est une norme internationalement reconnue qui décrit les exigences
d'un système de gestion par la qualité. En obtenant cette certification, le PPN montre qu'il a mis en place des processus et des procédures qui garantissent la cohérence
de ses services.
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NF X50-900 est une norme française qui met l'accent sur la recherche
et le développement, ainsi que sur la qualité de la prestation de services.
Cette certification démontre la capacité du PPN à mener une recherche technologique
et un service de haute qualité.
2021
DÉCEMBRE
IBiSA
La plateforme protéomique de Necker a été labellisée IBiSA. La plateforme a aussi reçu
des fonds IBiSA pour l'achat d'un nouvel automate pour la preparation des échantillons.
NOVEMBRE
Le séminaire de la SFR Necker
Pour la première fois depuis le début de la pandémie, nous avons pu organiser le 17 novembre 2021 en présentiel à la Faculté Necker le séminaire de la SFR Necker.
Au programme, nous avons eu des présentations de différentes équipes de l'INEM
et d'Imagine ainsi que de la plateforme iPSC et du LEAT.
Cela a été une belle opportunité d'échanges scientifiques entre les membres de l'INEM, d'Imagine et des plateformes !
FÉVRIER
timsTOF Pro MS (Bruker) - nouveau spectromètre de masse pour la plateforme Protéomique
La plateforme protéomique de Necker s'est dotée d'un nouveau spectromètre de masse (MS) timsTOF Pro MS (Bruker) et de deux systèmes de chromatographie liquide (LC), nanoElute et EvosepONE (cofinancés par DIM TG, Imagine, INEM et SFR).
Ce nouvel instrument présente des innovations majeures : i) la séparation des ions par mobilité ionique (IM) et ii) la fragmentation de tous les ions injectés (PASEF), permettant d'atteindre la plus grande profondeur d'analyse à la plus grande vitesse actuellement possible en protéomique.
Voici quelques exemples d'analyses récemment optimisées sur le timsTOF Pro :
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6000 protéines identifiées en une analyse (90 min) dans un tissu ou des cellules, contre 2000 protéines en 2h sur l'instrument précédent.
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5000 protéines quantifiées dans 10 sphéroïdes, ce qui permet une analyse approfondie des échantillons rares ou de faible abondance contre 1000 en 6 heures
sur l'instrument précédent.
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380 protéines dans un échantillon de plasma non déplété (1µl) en 40 min contre 250 protéines en 2h sur l'instrument précédent
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1000 protéines dans des échantillons de sueur (20 µl) en 40 min
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100 échantillons d'une cohorte peuvent être analysés en quelques jours
vs des mois auparavant
JANVIER
Le pole d'analyse de bio-images Necker est créé
Le pôle Necker Bioimage Analyses a été créé
en Janvier 2021 pour répondre aux besoins des scientifiques du site en analyse d’image biologiques et est spécialisé dans le service de traitement
et d'analyse de bio-images.
Le travail du pôle se fait en collaboration scientifique avec les utilisateurs
et les plateformes concernés.
2019
Chiara Guerrera: Prix Inserm Innovation 2019
La SFR Necker est fière d'annoncer que Chiara Guerrera, responsable scientifique de la plateforme de protéomique de la structure fédérative de recherche Necker, a reçu le prix Inserm Innovation 2019.
Ingénieur de recherche, Chiara Guerrera a développé une plateforme d'analyse protéomique de très haut niveau.
La plateforme de protéomique offre une technologie et une expertise de pointe principalement pour les études cliniques et translationnelles à travers sa double activité de service et de développement.
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2022
SEPTEMBRE
Déploiement de la technologie de biologie spatiale : Phenocycler‑Fusion (Akoya, Quanterix)
La plateforme d’histologie s’est équipée fin 2022 du système de marquage multiplex Phenocycler‑Fusion (Akoya), permettant la détection simultanée de plus de 40 biomarqueurs pour l’analyse spatiale des tissus. Cette technologie offre une lecture fine de l’organisation cellulaire dans son microenvironnement.
Le système comprend le Phenocycler pour le marquage automatisé et le PhenoImager pour l’acquisition en fluorescence. Il prend en charge les échantillons FFPE et FF, sur une zone de marquage de 18 × 34 mm et une épaisseur de tissu de 5 à 10 µm.
L’analyse des données est réalisée en collaboration avec le plateau Bio-image analysis (Nicolas Goudin) et la plateforme de bioinformatique.
La partie PhenoImager offre également la possibilité de scanner des lames OPAL, avec une capacité de 4 lames et des objectifs 20x et 40x.
AOÛT
Nouveau cytomètre Sony ID7000 pour la plate-forme
de cytométrie
La plateforme de cytométrie a remplacé son cytomètre analyseur Sony SP6800 par le Sony ID7000, dernier aboutissement de la technologie spectrale. Sa conception optique aboutie permet d’analyser simultanément 41 fluorochromes pour chaque échantillon cellulaire.
La technologie spectrale du SONY ID7000 est capable d’identifier les empreintes spectrales des signaux d’auto-fluorescence pour permettre de les analyser et de les gérer.
Le SONY ID7000 est équipé d’un échantillonneur automatique intégré capable de prendre en charge des séries de 24 tubes et des plaques de 384 puits et de refroidir les échantillons à 4°C.
Acquisitions récentes
Centre de Cytométrie, site Broussais - Analyseur spectral SP6800 SONY
Le SP6800 est un cytomètre analyseur très intuitif, destiné aux utilisateurs autonomes.
La technologie spectrale optimise la sensibilité et améliore la détection des signaux faibles en collectant les photons de 420 nm à 800 nm. La technologie spectrale simplifie la conception des couleurs multi-panneaux, en supprimant les filtres passe-bande et les matrices classiques de compensation.
La déconvolution spectrale mise en œuvre rend l'analyse plus simple et plus facile en séparant les empreintes spectrales individuelles de chaque fluorochrome. Nous obtenons une image plus complète des populations rares. Les complexités associées au travail avec les protéines fluorescentes et les fluorochromes excités par plusieurs lasers sont diminuées